たしかこのサイトに投稿されていた作品だったと逆行アスカが初号機の中にいてネルフや人類に復讐しようとする話だったかと後半はシンジに憑依していたシーンがあったとも思います。少ない情報ですが、かなり印象的な作品だったのでよろしくお願いします。
かなり今更ですが、「新世紀エヴァンゲリオン -PARADISE BANISHMENT-」だと思います。