今は閉鎖されたにじファンの小説で、
　１、アキトとルリは逆行者だった。
　２、転生者がミナトの所に居て、一緒にナデシコに乗り込んでいた。
　３、その転生者は、最初は原作にに介入する気がなかった。
　４、その転生者は、ナデシコに乗り込む前はミナトの会社のPCのOS
　　　をいじっていた。
　こういう小説を探しています。
　もし見つかったなら教えてください。
　お願いします。

お探しの作品は、おそらくですがハインツさんの『平凡男の改変日記』ではないでしょうか？

　はい、たしかそれでした。
　ありがとうございます。
　ですが、まだ転載されてないようですね。
　ひさしぶりに読みたかったのですが残念です。

ハインツさんの『機動戦艦ナデシコ　平凡男の改変日記』はハーメルンに移動となりました。
しかし現在7話とまでと、残りは改定中のようです。

タイトルは内容がわかりやすいものにしましょう。
捜索掲示板で作品を探すのは当たり前、こんな作品を探していますでは何の情報も見えません。